微流控芯片蛋白分析技術包括：預處理技術、分離技術、檢測技術等。

預處理技術有：酶解、富集、衍生、純化。

分離技術有：區帶電泳、凝膠篩分、等電聚焦、二維電泳。

檢測技術有：紫外吸收、激光誘導熒光、電化學、質譜。

微流控芯片在蛋白質研究中的應用有：性質鑒定（分子質量測定、等電點測定）、結構分析（氨基酸序列分析、構象分析、蛋白質結晶）、功能研究（糖基化、磷酸化、相互作用研究）、實際樣品分析（細胞內蛋白質表達、臨床樣品分析）等。

微流控芯片蛋白分析技術整體框架圖解如下：