前轉基因的檢測方法轉基因作物檢測方法大體分為兩種：一是檢測是否含有外源蛋白，即外源基因表達產物，主要采用酶聯免疫吸附法和試紙條法;二是檢測 是否含有外源基因(DNA)，主要有Southern雜交技術、基因芯片法和PCR檢測法。理論上來說，以上所介紹的轉基因檢測方法，只要改變相應的檢測 靶標，都可檢測不同的轉基因產品。

       但是實際應用中，以檢測外源蛋白的轉基因檢測方法存大很大的局限性，食品的復雜成分會干擾檢測效果，并且加工過的轉基因食品中的蛋白質抗原性很容易受 破壞，從而會影響檢測結果的靈敏度。此外，該方法需要大量的抗體和抗原。目前，商品化的ELISA檢測試劑盒和膠體金試紙條只能檢測少數幾種轉基因產品， 且一種試劑盒或試紙條只能針對某一特定轉基因產物，不能針對多種混合成分的食品樣品進行檢測。

       基因水平的檢測方法具有適用范圍廣的優勢，只要樣品中有DNA存在，就能被檢測，不受食品混合、復雜成分的干擾，適用于轉基因原料、初加工和深加工食品的檢測，而且有很好的特異性和靈敏度，已經發展為常用的轉基因食品檢測方法。