Biomicrofluidics：菌群研究中可用的微流控技術（綜述）

① 微流控技術通過微流控芯片和細胞捕獲實現對微生物單個細胞的追蹤觀察，是微生物研究中的新方法；

② 現有的微流控（芯片）裝置可以分為連續流動裝置、微液滴裝置、（試）紙裝置和數字微流控裝置等四類；

③ 使用流體陷阱、微孔播種、電勢陷阱、微液滴包裝和光學陷阱等方法捕獲單細胞，從而在單細胞層面實現追蹤和持續監測；

④ 結合微流控可以實現單細胞水平上的基因測序、表達譜分析、代謝分析和疾病篩查等，具有十分光明的應用前景。

Microfluidics: A new tool for microbial single cell analyses in human microbiome studies

2017-12-13  DOI: 10.1063/1.5002681

TP：氯胺酮的抗抑郁效果或與腸-腦軸相關

① 2000年，Berman等報道一定劑量氯胺酮可以起到抗抑郁效果，但其也有令病人產生幻覺等副作用；

② 氯胺酮包含有R型和S型，比較兩種化合物對社交失敗壓力（CSDS）模型小鼠腸道菌群的影響及抗抑郁效果；

③ CSDS小鼠的柔膜菌門及放線菌門的水平發生變化；

④ 兩種氯胺酮可抑制CSDS小鼠δ變形菌綱的增長，但僅有R型可顯著抑制柔膜菌綱的減少；

⑤ 這可以解釋為什么R型氯胺酮抗抑郁效果更好，且副作用小。

Possible role of the gut microbiota-brain axis in the antidepressant effects of (R)-ketamine in a social defeat stress model

2017-12-18  DOI: 10.1038/s41398-017-0031-4

NC：腸道活潑瘤胃球菌如何識別唾液酸？

① 活潑瘤胃球菌是典型的人體腸道共生菌，利用反式唾液酸酶降解黏液蛋白，該酶具有唾液酸特異的糖結合蛋白（RgCBM40）;

② RgCBM40有CBM40蛋白亞家族典型的β-三明治夾層結構，特異結合α2,3或α2,6-唾液酸乳糖苷，特異性識別具有廣譜性；

③ RgCBM40可與杯狀細胞分泌的粘液以及純化的黏液蛋白結合，可視為新的黏附素，其結構廣泛分布于厚壁菌門；

④ 活潑瘤胃球菌以唾液酸為媒介，與腸粘液結合；

⑤ 為研究共生菌在腸道定殖與分布提供了新信息。

Unravelling the specificity and mechanism of sialic acid recognition by the gut symbiont Ruminococcus gnavus

2017-12-19  DOI: 10.1038/s41467-017-02109-8

Gut：設計PPI治療方案，多考慮點

① 幽門螺旋桿菌陽性患者長期接受質子泵抑制劑（PPI）治療會促進特殊腺體流失而導致萎縮性胃炎，故建議先根除幽門螺桿菌；

② 153（0.24%）名進行幽門螺旋桿菌根除治療后的患者，在PPI治療后，中位7.6年間患上胃癌；

③ PPI治療設計時，要考慮患者初始胃部狀況如萎縮性胃炎和腸上皮化生等，以及不同PPI（如奧美拉唑、雷貝拉唑、蘭索拉唑等）在抑酸強度上的差異，強烈抑酸作用使萎縮性胃炎惡化；

④ 還應考慮飲食習慣和癌癥家族史等其他危險因素。

Several aspects in study design need further consideration

2017-12-19  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315692

Nutrients：體外利用糞菌發酵不同益生元

① 在糞便菌群體外發酵系統中，比較5種常見膳食纖維（β-葡聚糖、商業化β-葡聚糖Oatwell、低聚木糖、菊粉、包含菊粉/果膠/纖維素/半纖維素的商品化益生元WholeFiber）的益生元效應；

② 發酵12h后，OatWell產生最多的丙酸鹽，與β-葡聚糖的效應相似；

③ 發酵24h后，低聚木糖顯著增加雙歧桿菌屬；

④ 菊粉及WholeFiber可增加有益菌屬Collinsella，與之前的臨床研究結果一致；⑤ 所有益生元均可促進有益短鏈脂肪酸的形成。

Prebiotic Dietary Fiber and Gut Health: Comparing the in Vitro Fermentations of Beta-Glucan, Inulin and Xylooligosaccharide

2017-12-15  DOI: 10.3390/nu9121361

JFF：苦瓜調節肥胖大鼠腸道菌群并改善代謝

① 苦瓜富含膳食纖維和其他生物活性化合物，給肥胖大鼠喂食高脂飲食（HFD）并用苦瓜粉（BMP）處理8周；

② 與HFD組相比，BMP有效延緩體重增加和提高胰島素敏感性，降低內毒素負荷；

③ BMP改變了腸道菌群，尤其是勞特氏菌屬和Allobaculum屬的豐度，也改變了代謝譜，包括有機酸、氨基酸和糖類的代謝；

④ 屬水平的特定腸道菌群與有效生物標志物之間有顯著的相關性；

⑤ 在肥胖小鼠中，BMP通過恢復腸道菌群和腸道代謝產物發揮抑制胰島素抵抗和抗炎作用。

Modulation of gut microbiota and gut-generated metabolites by bitter melon results in improvement in the metabolic status in high fat diet-induced obese rats

2017-12-22  DOI: 10.1016/j.jff.2017.12.050

JAM：飼料中添加中藥可顯著改善銀鯽的腸道菌群

① 研究具有抗炎和免疫活性的玉屏風散（防風、黃芪和白術）作為中藥飼料添加劑對異育銀鯽腸道菌群的影響；

② 中藥可增加異育銀鯽的菌群豐度、多樣性以及均勻性，在門水平上，變形桿菌門、放線菌門、 酸桿菌門數量顯著增加，梭桿菌門數量顯著降低；

③ 在屬水平上，潛在的病原體如發病氣單胞菌、 鮑曼不動桿菌和希瓦氏菌水平降低，潛在的益生菌如乳桿菌、 乳酸乳球菌、芽孢桿菌和假單胞菌水平升高；④ 為中藥在水產養殖方面應用提供依據。

Significant improvement of intestinal microbiota of gibel carp (Carassius auratus gibelio) after traditional Chinese medicine feeding

2017-12-18  DOI: 10.1111/jam.13674

Aquaculture：虹鱒魚吃點大蒜，長得塊菌群也顯獨特

① 240條健康虹鱒魚分為4組，分別在飼料中添加0、1%、1.5%、2%的大蒜提取物，持續120天；

② 相比于對照組，補充了大蒜的虹鱒魚的體重增加及比生長速率顯著升高；

③ 對腸黏膜菌群進行分析發現，對照組虹鱒魚中豐度最高的是Deefgea菌屬及氣單胞菌屬；

④ 飼料中大蒜含量為1%及1.5%的虹鱒魚中，腸道菌群豐度最高的是Deefgea菌屬及支原體屬；

⑤ 飼料中大蒜含量為2%的虹鱒魚中，腸道菌群豐度最高的是氣單胞菌屬。

Effects of garlic-supplemented diet on growth performance and intestinal microbiota of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

2017-12-17  DOI: 10.1016/j.aquaculture.2017.12.022

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